自序序一序二序三序四序五凡例卷一·医学溯源养生稽古阴阳水火生克运气运气总论十二化五运歌十二支年六气歌流年起六气歌客气交日歌逐年主气歌逐年客气歌脏腑（附：腔子、脂膜）脏象应天地脏腑贵贱脏腑命名释义脏腑相
仁斋直指方论
古今名医方论
第1部分第2部分第3部分第4部分
卷第一孔志约序梁·陶隐居序合药分剂料理法卷第二诸病通用药疗风通用风眩头面风中风脚弱久风湿痹贼风挛痛暴风瘙痒伤寒大热劳复温疟中恶霍乱转筋呕大腹水肿肠下痢大便不通小便淋小便利溺血消渴黄胆上气咳嗽呕吐痰饮宿
序针灸资生经第一偃伏头部中行十穴偃伏第二行左右十四穴偃伏第三行左右十二穴侧头部左右二十六穴正面部中行六穴面第二行左右十穴面第三行左右十穴面第四行左右十穴侧面部左右十四穴（更二穴）肩膊部左右二十六穴背俞
并言卷上神字号玉华散圣字号通利散功字号积雪膏巧字号定风针附 风热喉辨方附 积热喉辨方附 痰热喉辨方附 虚热喉辨方附 针灸须知附志卷下单鹅风双鹅风单口风松子风搭颊风外锁风斗底风木舌风重舌风莲花舌牙蜞风双
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序（一）自记序（二）重刻外科证治弁言凡例卷一痈疽证治统论痈疽部位名记胃气论论肿论溃论敛论痛论痒五善歌七恶歌饮食宜忌论阳痈证治则例阴疽证治则例烂溃不敛治法翻花起肛治法患孔毒根治法漏管治法多骨治法毒瓦斯攻
叙上卷一、太极图抄引二、太极图（图缺）三、太极图说四、不知《易》者不足以言太医论五、问三才所同者于人身何以见之六、命门图说（图缺）七、右肾水火辩九、《难经正义》三焦评附：东垣三焦论十、问诊三焦包络十一