序一序二序三例言卷上疡证总论疡科调治心法略义申明外疡实从内出论辨脑疽对口论脑疽后论辨百会疽玉枕疽论辨夭疽锐毒虚实论辨大头瘟抱头火丹毒论辨鬓疽额疽论辨凤眉疽眉心疔眉发论辨眼丹眼漏论辨眼胞菌毒眼胞痰核论辨
伤寒微旨论
扁鹊神应鍼灸玉龙经
石山医案
黄帝内经素问遗篇
金匮方歌括
自序卷之一·治法通论卷之一·调经门经候总论经闭血崩赤白带下白浊白淫卷之二·杂症门上（杂证男女一也。此二卷方论，出女科书，多杂病书所遗，故存之耳。）虚劳客热寒热恶寒中风飞尸血厥螈颤振惊悸颠狂血风烦闷血风
第1部分第2部分第3部分第4部分
伤寒医鉴论脉证论六经传受论汗下论阳厥极深论湿热发黄论不得眠论呕吐论湿热下利论霍乱论好用寒药论小儿疮疹
序一序二序三自序卷一草部黄甘草人参北沙参丹参元参白术苍术葳蕤黄精狗脊石斛远志石菖蒲牛膝甘菊花五味子天门冬麦门冬款冬花紫菀旋复花百部桔梗马兜铃白前白芨半夏天南星贝母栝蒌实天花粉夏枯草昆布独活羌活防风本葛