一、中风门二、风痹门三、心腹痛门四、霍乱门五、呕吐门六、气门七、痰饮门八、痨瘵门九、胁痛门十、腰痛门十一、香港脚门十二、积聚门十三、脾胃门十四、补益门（一）导引行气法（二）虾蟆行气法（三）入火法（四）
序一序二序三序四伤寒十六证类方自叙伤寒证六经提纲太阳经提纲太阳经坏病提纲太阳经坏病结胸痞证提纲阳明经提纲阳明经虚证提纲少阳经提纲少阳经坏病提纲少阳经坏病结胸痞证提纲太阴经提纲少阴经提纲厥阴经提纲伤寒十
伤寒微旨论
卫济宝书
长沙方歌括
简介序方按
凡例卷一九恨十三不可学十传摹看手指筋纹乃医家异教说治病不可关门杀贼说治病不可开门揖盗说汤方内更换药味说看病秘诀死症辨卓溪家传口诀推拿代药赋卷二阐明五脏生克以知补母泻子辨脐风辨胎寒辨胎热辨胎毒发丹辨胎惊
序一序二序三卷之一一辨气二辨色三辨舌辨传经夹血夹脾虚夹肾虚夹亡血夹疝夹心胃痛夹哮喘卷之二表证发热恶寒寒热往来头痛头眩头胀头重目胀项强酸背痛酸腰痛酸膝痛酸胫腿痛酸足痛肩臂痛酸腕痛周身骨节酸痛身重自汗盗汗
序按语八十五条附方
自序凡例卷一月经治月经病方卷二胎前治胎前病方秦氏世传逐月养胎方卷三小产治小产病方临产治临产病方附前人治临产效方卷四产后治产后病方卷五带下治滞下病方崩漏治崩漏病方附录前人治临产效方卷六妇女杂病治妇女杂病