一、中风门二、风痹门三、心腹痛门四、霍乱门五、呕吐门六、气门七、痰饮门八、痨瘵门九、胁痛门十、腰痛门十一、香港脚门十二、积聚门十三、脾胃门十四、补益门（一）导引行气法（二）虾蟆行气法（三）入火法（四）
养生肤语
医源
金匮方歌括
血證論卷一 陰陽水火氣血論卷二 吐血卷三 汗血卷四 便血卷五 瘀血卷六 癆瘵卷七卷八 方劑
序一序二序三卷之一初诞第一问护养法第二问噤风撮口脐风第三问脉法第四问（无方）变蒸第五问五脏所主第六问（无方）五脏病证第七问（无方）肝脏第八问心脏第九问脾脏第十问卷之二肺脏第十一问肾脏第十二问面上证气色
序总述修养宜行外功第一合行外功诀十二段锦歌八段杂锦歌擦面美颜诀六字治脏诀六字行功根据式样歌六字行功应时候歌六字行功各效验歌修养宜内联功第二修养宜宝精宝气宝神第三总论精气神精气神全神语一字安心之要修养宜
正文补编·卷上论温热病舌黄舌绛烟煤舌舌黑舌淡红无色舌白如粉验齿温热论补编·卷下崩漏标本证治崩漏虚实证治论妇女湿温病韩善征辟产后忌寒凉宜温热及大补气血论
序原叙原例（次序略经更定）通行经络（补）人参高丽参黄精大枣面鹿肉羊肉鳝鱼淡菜人乳人气紫河车（和）甘草香附连翘合欢皮芜荑海桐皮乳香没药竹沥荆沥广皮枳子菠菜荠菜白豆酒灵砂百沸汤鹈鹕油蜂蜜（攻）大戟甘遂商陆
序一序二序三自序凡例卷之一伤寒门（四十三则）中寒门（七则）卷之二中风门（二十五则）痹证门（十一则）心痛门（六则）胁痛门（五则）头痛门（六则）腹痛门（六则）腰痛门（六则）卷之三咽喉痛门（七则）牙齿痛门（