序序凡例卷一述原引种预防禁忌辨证卷二论治（上）卷三论治（下）卷四运气选案
第1部分第2部分
素问上古天真论篇第一四气调神大论篇第二生气通天论篇第三金匮真言论篇第四阴阳应象大论篇第五阴阳离合论篇第六阴阳别论篇第七灵兰秘典论篇第八六节藏象论篇第九五藏生成篇第十五藏别论篇第十一异法方宜论篇第十二移
卷第一治伤寒时气、温疫初起方治疫气伤寒，三日以后不解者方治伤寒中风方治伤寒汗出不解如疟方治伤寒胸闷、腹满方治伤寒后呕恶不食虚羸方治伤寒后烦渴及口干方治伤寒后下利脓血及发斑方治伤寒鼻衄、喉痛、疮方治伤寒
自序祝序一·辨诊脉大法二·辨浮脉所统有十三·辨沉脉所统有五四·辨迟脉所统有五五·辨数脉所统有二六·辨滑脉所统有一七·辨涩脉八·辨肺大肠脉九·辨心小肠脉十·辨脾胃脉十一·辨肝胆脉十二·辨肾膀胱脉十三·辨
脉诀
孙序卷一三吴治验万历龙飞二年吴小峰小川目疾万历甲戌沈中丞案张孝廉后渠大头疫吴江孙行人痛风（有发明）郑都谏公子痘（有发明）张文学子心病虚弱（有发明）大宗伯董浔阳翁脾胃疾（有发明）董龙山夫人便血马厨疟痢并
魏序凡例卷一水部（十四种）立春雨水露水冬霜腊雪水夏冰甘澜水逆流水井泉水地浆百沸汤阴阳水齑水磨刀水磨刀水火部艾火灯花土部（九种）黄土东壁土胡燕窠土蚯蚓泥乌爹泥伏龙肝乌古瓦墨百草霜金部（十七种）金箔银箔自
序卷一跌打损伤小引看伤有治无治之论秘传下手口诀治周身口诀损伤秘传口诀秘传接骨口诀效方开后秘传要旨总论秘传损方药名十二咏卷二总论卷三跌打水药歌观音针（一点一针）雷火针九龙针太乙救苦针又麻药方附录经验杂方
明目论看眼诀图眼病歌诀冷眼歌诀热眼歌诀药性光明赋五经虚泻五经火眼目虚实冷热论点药药性炮炼法男女禁忌看眼法演药法点药法制药法煎膏法研药法合药法用药法服药法禁忌主药方辅药方加减方按五轮治疗捷法四季加减煎药