序一序二自序跋凡例太极图（图缺）命门水火图（图缺）五气图（图缺）卷之一医论命门水火图说五气图说论膀胱者州都之官津液藏焉气化则能出矣论补脾补肾治血贵静广嗣方论论诸痿胃气当察辨利痢脉病之殊治病求本驳诸家痨
简介序凡例卷首卷一卷二卷三卷四卷五卷六卷七卷八卷九卷十卷十一卷十二
序一序二自叙天癸确论调经经水先期第一经水先期第二经水先期第三经水先期第四经水再至第五经水再至第六经水后期第一经水后期第二经水后期第三经水后期第四经水两月一至第五经水两月一至第六经水或先或后忽多忽少或来
铜人针灸经点校说明卷一卷二卷三卷四卷五卷六卷七
简介祖剂细目祖齐小叙卷之一卷之二卷之三卷之四
弁言序题词跋卷一卷二卷三卷四
本草图经序本草图经奏敕玉石上品卷第一玉屑玉泉（图缺），文具玉屑条下。丹砂空青曾青（图缺），文附空青条下。绿青扁青，文具绿青条下。石胆云母石钟乳殷孽，文具石钟乳条下。孔公孽，文具石钟乳条下。石花，文具石
序一序二卷之上杂病门疟消渴喉痛肠痈肩痈咳嗽疮疡瘾疹疥癣酒鼻健忘痨瘵咳血肺痿痿怖赫曦（?）温病手心热发热饮酒发热香港脚梦遗淋小便不通泄泻膈噎伤食卷之下大风痛风疝内伤中风暑注夏暑风湿郁病火溺血痰饮肺胗杂合
订正仲景全书伤寒杂病论 原序订正仲景全书伤寒论注辨太阳病脉证并治上篇桂枝汤方桂枝加附子汤方白虎加人参汤方调胃承气汤方五苓散方麻黄杏仁甘草石膏汤方十枣汤方桂枝人参汤方葛根黄芩黄连汤方桂枝去芍药汤方桂枝去
经络统序原始脏腑联系分合详说脏腑联系分合详说手太阴肺经（左右共二十二穴）手阳明大肠经（左右共四十穴）足阳明胃经（左右共九十穴）足太阴脾经（左右共四十二穴）手少阴心经（左右共十八穴）手太阳小肠经（左右共