序卷之一头目卷之二耳鼻舌卷之三口面项喉卷之四心神卷之五胸腹卷之六身卷之七背手足卷之八溺孔肛门
卷首集例先天图说天地人物气候相应说天地人物气候相应图释方历代医学姓氏三代以前，圣君贤相，创为医药，以济死生者也。秦汉以后，有通经博史，修身慎行，闻人巨儒，兼通乎医。医极其明者也。以医为业，世代相承者也
简介医方集宜内容细目叙凡例八款六气十二经见证卷之一卷之二卷之三卷之四卷之五卷之六卷之七卷之八卷之九卷之十
简介大小诸证方论序秘传小儿科方论秘传杂症方论
简介序卷一卷二卷三卷四附
卷之一周身经穴赋十二经脉歌十二经本一脉歌经穴起止歌十五脉络歌经脉气血多少歌禁针穴歌禁灸穴歌血忌歌逐日人神歌九宫尻神歌太乙人神歌孙思邈先生针十三鬼穴歌长桑君天星秘诀歌马丹阳天星十二穴并治杂病歌四总穴歌千
十问合阴阳天下至道谈胎产书杂禁方养生方却谷食气
题辞卷上脏腑经络先后病脉证第一湿病脉证第二百合狐惑阴阳毒病证治第三疟病脉证并治第四中风历节病脉证并治第五血痹虚劳病脉证并治第六肺痿肺痈咳嗽上气病脉证治第七奔豚气病脉证治第八胸痹心痛短气病脉证治第九腹满
旅舍备要方
自序卷之一痈疽门痈疽原委论第一痈疽治法总论第二痈疽阳症歌第三痈疽阴症歌第四痈疽半阴半阳症歌第五痈疽五善歌第六痈疽七恶歌第七治病则例歌第八痈疽灸法并禁灸疮穴第九论病生死法第十察形色顺逆第十一病有三因受病