自序卷一一明望色之法望色论（附律一条）一明闻声之法闻声论（附律二条）一明辨息之法辨息论（附律一条）一明胸中大气之法大气论（附律一条）一明问病之法问病论（附律一条）一明切脉之法切脉论（附律一条）一明合色
叙自叙凡例医学集成卷一阴阳诸论天地阴阳人身阴阳病有阴阳药有阴阳阴虚证论阳虚证论先天解说后天解说丹田解说五行生克五脏六腑脏腑表里脏腑所属足六经辨手六经辨十二经络寸关尺解六部脉解脉定至数脉定权衡浮沉统属（
兰室秘藏
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简介自序凡例卷首卷一卷二卷三卷四卷五卷六卷七卷八卷九卷十卷十一卷十二卷十三卷十四卷十五卷十六
注序补注《明医杂着》序卷之一仲景东垣河间丹溪诸书孰优处方药品多少论异法方宜论丹溪治病不出乎气血痰郁产后发热伤寒时气病后调养泄泻劳热饮食劳倦内伤发热伤寒发热伤暑发热病有感伤中心腹疼痛病时静心息虑发热论补
总论调理精血论直指真源论男女服药论交会宜忌日诊妇人有妊歌妊娠杂病并产生死二歌余不能尽录也调元调经安胎便产转女为男法附方集验方广嗣附方附论一篇论童壮论衰老
石药尔雅
总论出产择地土收采按时月藏留防耗坏贸易辨假真咀片分根梢制造资水火治疗用气味药剂别君臣四气五味七情七方十剂五用修合条例服饵先后各经主治引使用药法象卷之一草部上人参黄耆甘草白术生干地黄当归牛膝黄精远志石菖
小儿简要辨证节录夏禹铸望苗窍诀验虎口法初生调护脐风乳子未半岁服药法惊风辟妄一曰误搐一曰类搐暑证阴暑小儿中暑吐泻或卒然昏倒疟疾痢疾咳嗽小儿咳嗽不出声肺实咳嗽痰喘小儿痰壅喘咳小儿百嗽不止丹毒疮痈霍乱干霍乱