叙卷一·琼瑶神书天部宋徽宗皇帝崇宁五年琼瑶真人一书手法序一琼瑶真人用升阳升阴气上气下之手法讲论歌二琼瑶标本运气歌三琼瑶辨十二经水火分治法四宋徽宗崇宁皇帝论五论手足阴阳流注篇六络脉传注周流不息七琼瑶真人
自序卷一医范医鉴慎疾保生慎药求医诊法脉用药卷二古人今人古书今书卷三形体中风伤寒阴证阳证暑暑风霍乱转筋（俗称吊脚痧）热热入心胞疫痧疟三阴疟痢泻疝咳嗽噎吐头痛胁痛腹痛肝病七情不寐卷四吐血诸血汗疸肿消伤食邪
简介序上卷中卷下卷
诸病主病诗
自序凡例卷上寒总论肾虚人易犯伤寒论不服药为中医论两感论时行疫症伤寒十六症类伤寒六症内伤外感辨治伤寒宜早视伤寒宜详辨成氏再传之讹六经七日病愈论仲景三百九十七法一百一十三方论陶氏辨差认十六条察色法察目法察
第1部分第2部分第3部分第4部分
序一序二一卷 摄生类一、上古之人春秋百岁今时之人半百而衰二、上古圣人之教下三、古有真人至人圣人贤人四、四气调神五、天气清静藏德不止圣人从之故无奇病六、四时阴阳从之则生逆之则死七、不治已病治未病二卷
简介原序卷一卷二卷三卷四卷五卷六卷七卷八卷九卷十卷十一卷十二卷十三卷十四卷十五卷十六卷十七卷十八卷十九卷二十卷二十一卷二十二卷二十三卷二十四卷二十五卷二十六卷二十七卷二十八卷二十九卷三十卷三十一卷三十
叙一叙二叙三自叙卷上诸论辨正徐洄溪先生医者误人无罪论读王孟英治张养之久病伏邪医案论临症必先读书论治病当悉未病论烟痢宜通不宜塞论萝卜缨为治痢妙药论痰症随宜施治论治喉症宜分三大纲论喉症吹药论推摩法论治小儿
前序序石山先生自赞卷一痈疽脉一治疮脉诀七恶五善二诸恶疮五逆三定痈死地分四背上九处不可病痈五痈发有不可治六发背治之难易七占色候生死八痈之源有五九生痈所感不同十肺肝肾痈症十一痈生原于脏腑十二辨脏腑内疮十三