序上卷背痈论肺痈论无名肿毒论对口疮论脑疽论囊痈论臂痈论乳痈论肚痈论恶疽论疔疮论唇疔论鬓疽论下卷杨梅疮论腰疽论瘰论顽疮论脚疽论痔漏论大肠痈论小肠痈论
袁序陆序陆序自序卷一原因原贼邪原风湿原荣卫原易伤寒温热延医论论河间说伤寒之误原瘴原痧原胎成注《伤寒论》论五志论阴阳交并论虫论温疫总论疟论尸疰疳蒸四大症论虚劳论传尸劳论肺萎论正水风水诊法论女劳疸黑疸同治
内外伤寒辩惑论
第1部分第2部分第3部分第4部分第5部分
叙万氏幼科源流序卷之一形气发微论原病论入门审候歌观面部五脏形歌观面部五色歌三关脉纹变见歌小儿正诀指南赋胎疾脐风变蒸变蒸兼证幼疾五脏诸证肝经主病肝经兼证肝所生病急慢惊风急惊风有三因卷之二急惊风证急惊风变
卷一针道源流针灸直指针灸方宜始论刺热论刺疟论刺咳论刺腰痛论奇病论刺要论刺齐论刺志论长刺节论皮部论经络论骨空论刺水热穴论调经论缪刺论经刺论巨刺论手足阴阳流注论卫气行论诊要经终论刺禁论刺法论五刺应五脏论：
引凡例卷一上五脏六腑仰人尺寸（图缺）伏人尺寸（图缺）手足阴阳流注中指同身寸法手太阴肺经手阳明大肠经足阳明胃经足太阴脾经手少阴心经手太阳小肠经足太阳膀胱经卷一下足少阴肾经手厥阴心包络经手少阳三焦经足少阳
房中补益
序录上序录下解毒服药忌食药不宜入汤酒者上石类上草木类上虫兽类玉石上品玉石中品玉石下品草木上品草木中品草木下品虫兽上品虫兽中品虫兽下品玉石三品玉石上品玉屑玉泉丹砂水银空青曾青白青扁青石胆云母朴硝硝石矾石
序一序二卷之上杂病门疟消渴喉痛肠痈肩痈咳嗽疮疡瘾疹疥癣酒鼻健忘痨瘵咳血肺痿痿怖赫曦（?）温病手心热发热饮酒发热香港脚梦遗淋小便不通泄泻膈噎伤食卷之下大风痛风疝内伤中风暑注夏暑风湿郁病火溺血痰饮肺胗杂合