人体解剖学歌诀内容运动系统运动系统歌诀全身骨歌诀各部椎骨特点歌诀胸骨歌诀颅骨歌诀鼻旁窦歌诀脊柱的韧带歌诀脊柱形态歌诀胸廓歌诀肩关节歌诀肘关节歌诀手腕骨歌诀膝关节歌诀跗骨歌诀颅底内面歌诀新生儿颅骨歌诀膈
卷第一叙论太阳证阳明证少阳证太阴证少阴证厥阴证两感证三阴三阳传病证卷第二可发汗证不可发汗证四逆证和表证可下证（血证附）不可下证可水不可水证可吐不可吐证可灸不可灸证可火不可火证可温证火邪证卷第三结胸证心
仁斋直指方论
序卷上脾胃虚实传变论脏气法时升降浮沉补泻图说脾胃胜衰论补脾胃泻阴火升阳汤肺之脾胃虚论升阳益胃汤君臣佐使法分经随病制方通气防风汤羌活胜湿汤用药宜禁论《内经》、仲景所说脾胃卷中气运衰旺图说饮食劳倦所伤始为
百家针灸歌赋
编写说明导言一、干支配属（一）天干的阴阳五行属性与方位（二）天干配属脏腑经络与五季（三）天干配属五运（四）地支纪月与所属四季（五）地支所属阴阳五行（六）地支配合时间与脏腑经络二、年、月、日、时干支掌上
序总述修养宜行外功第一合行外功诀十二段锦歌八段杂锦歌擦面美颜诀六字治脏诀六字行功根据式样歌六字行功应时候歌六字行功各效验歌修养宜内联功第二修养宜宝精宝气宝神第三总论精气神精气神全神语一字安心之要修养宜
《本草衍义》提要序卷一序例上衍义总叙卷二序例中卷三序例下内容卷四玉泉丹砂空青绿青云母石钟乳朴硝芒硝硝石英硝矾石滑石紫石英白石英赤石脂白石脂石中黄子婆娑石无名异菩萨石卷五金屑银屑水银水银粉雄黄雌黄石硫黄
叙上卷一、太极图抄引二、太极图（图缺）三、太极图说四、不知《易》者不足以言太医论五、问三才所同者于人身何以见之六、命门图说（图缺）七、右肾水火辩九、《难经正义》三焦评附：东垣三焦论十、问诊三焦包络十一
《卫生易简方》序进《卫生易简方》表稿卷之一诸风诸寒诸暑诸湿伤寒卷之二头风头痛眩晕霍乱呕吐泄泻诸痢诸疟脾胃五噎反胃咳嗽卷之三痰饮喘急咳逆诸气疝气心痛腰胁痛发痧脚气五痹五疸卷之四虚劳骨蒸劳瘵泄精赤白浊吐血