张序卷上卷下跋
一、中风门二、风痹门三、心腹痛门四、霍乱门五、呕吐门六、气门七、痰饮门八、痨瘵门九、胁痛门十、腰痛门十一、香港脚门十二、积聚门十三、脾胃门十四、补益门（一）导引行气法（二）虾蟆行气法（三）入火法（四）
简介普济方有关说明卷一 方脉总论 辨男女形生神毓论卷二 方脉总论 辨奇经八脉法卷三 方脉总论 辨七表八里脉法卷四 方脉总论 九道病脉卷五 方脉药性总论 药性总论卷六 五运六气图卷七 运气图 甲子岁图卷
金匮要略金匮要略方论序卷上 藏府经络先后病脉证第一卷上 痉湿喝病脉证第二卷上 百合狐惑阴阳毒病证治第三卷上 疟病脉证并治第四卷上 中风历节病脉证并治第五卷上 血痹虚劳病脉证并治第六卷上 肺痿肺痈咳嗽上
鬼门十三针
六因条辨卷上春温辩论春温条辨三十条论伤暑中暑中热辨误伤暑条辨二十六条中暑条辨十一条中热条辨八条六因条辨卷中伏暑辨论伏暑条辨二十八条秋燥辨论秋燥条辨十一条冬温温毒条论冬温条辨十条温毒条辨四条六因条辨卷下
张序卷首保产卷一禀赋脏能脉候胎病胎热胎寒胎肥胎怯胎黄胎惊锁肚不啼不乳脐风撮口噤口变蒸卷二杂症咽喉齿舌口耳目鼻囟颐脐语迟夜啼龟胸龟背鹤节行迟五软五硬卷三痘疮总诀卷四痘疮发热三日诀见点三日诀卷五痘疮起胀三
脏腑经络先后病脉证治第一湿病脉证第二百合狐惑阴阳毒病证治第三疟病脉证并治第四中风历节病脉证治第五血痹虚劳病脉证治第六肺痿肺痈咳嗽上气病脉证治第七奔豚气病脉证治第八胸痹心痛短气病脉证治第九腹满寒疝宿食病
谢氏《发背对口治诀论》序总论附∶谢氏外科秘法附∶对口方附∶杨州存济堂药局膏药方
序自序自序杂症大小合参凡例（小引）杂症大小合参凡例痘疹全集凡例杂症痘疹药性主治合参凡例杂症大小合参卷首上 内经纂要上古天真论篇四气调神大论篇生气通天论篇金匮真言论篇阴阳应象大论篇阴阳离合论篇阴阳别论