叙卷上伤寒论难读并宜补大旨三阳三阴分经名义伤寒重病多是下焦伏寒伏寒触发与伤寒时温脉证并病机异同即病伏气直中传经四证异同晚发是伤寒正病两感有三水气凌心即是三焦伤伤寒杂病皆有之无端暴喘即是寒入命门伤寒杂病
自序卷一一明望色之法望色论（附律一条）一明闻声之法闻声论（附律二条）一明辨息之法辨息论（附律一条）一明胸中大气之法大气论（附律一条）一明问病之法问病论（附律一条）一明切脉之法切脉论（附律一条）一明合色
鬼门十三针
简介鸡峰普济方内容细目序卷第一 诸论卷第二 香港脚卷第三 伤寒中暑附卷第四 补虚卷第五 劳疰卷第六 血小便卷第七 心·肺卷第八 脾·胃·肝·肾卷第九 治热卷第十 泻痢（呕吐附）疟卷第十一 妇人崩漏卷第
孙序卷一三吴治验万历龙飞二年吴小峰小川目疾万历甲戌沈中丞案张孝廉后渠大头疫吴江孙行人痛风（有发明）郑都谏公子痘（有发明）张文学子心病虚弱（有发明）大宗伯董浔阳翁脾胃疾（有发明）董龙山夫人便血马厨疟痢并
序自序卷之上脉法脉诀歌金匮解（方附本条）逐月养胎辨并慎择医药论受胎试验法（附方）试男女胎法三禁教养宜忌论饮食七情禁忌论妊娠药忌歌种子补益受胎寿子论胎动安胎论恶阻论胞漏并小产论诸痛论（附孕痈）胎逆上逼胀
原序序卷之一麻疹骨髓赋（增朴）静远主人麻疹西江月（删订）麻证条目法旨用药要诀（删订）增订治麻问答捷要麻疹形式要旨证治秘诀麻疹证治大略括密斋治法大略括验麻色吉凶麻疹轻证麻疹重证麻疹不治证麻疹死证括应用药
谢氏《发背对口治诀论》序总论附∶谢氏外科秘法附∶对口方附∶杨州存济堂药局膏药方
《卫生易简方》序进《卫生易简方》表稿卷之一诸风诸寒诸暑诸湿伤寒卷之二头风头痛眩晕霍乱呕吐泄泻诸痢诸疟脾胃五噎反胃咳嗽卷之三痰饮喘急咳逆诸气疝气心痛腰胁痛发痧脚气五痹五疸卷之四虚劳骨蒸劳瘵泄精赤白浊吐血
本草乘雅半偈自序本草乘雅义例别录〔衍〕本草乘雅凡例乘雅半偈采录诸书大意第一帙紫芝青芝赤芝黄芝白芝黑芝人参甘草黄蓍实菟丝子莲实茯苓柏实云母丹砂菖蒲赤箭薯蓣干地黄枸杞菊花麦门冬太一余粮石钟乳龙骨蜂蜜第二帙